Pembina genome?

• April 24, 2024

Enam belas tahun yang lalu dunia bertemu mamalia klon pertama: Dolly domba. Di luar kekaguman atau ketakutan yang disebabkan pada masa itu, mendapatkan maklumat di biologi molekul Ia telah mempercepatkan pada kadar yang mengagumkan kerana pembangunan teknologi baru, lebih cekap, lebih cepat dan lebih mudah diakses.

Ini menimbulkan kelemahan: bagaimana untuk menganalisis dan memahami semua dunia data dan maklumat untuk mengesan dan menyelesaikan masalah biologi? Dalam era booming bangunan genom, penyelidik menggabungkan kemajuan dalam sains genom dan jentera komputer untuk membuat pangkalan data maklumat biologi dalam buku elektronik.

Pakar genomik pengkomputeran Pusat Sains Genomik UNAM membimbing saintis lain ke dalam kedalaman sifat organisma. Misinya adalah untuk membantu penyelidik dalam kajian gen dan genom, sebagai tambahan kepada pemodelan dan meramalkan konsep biologi, seperti tingkah laku sel.

Salah satu pencapaian yang paling besar dalam pasukan ini, diketuai oleh doktor Julio Collado Vides , adalah untuk mendapatkan urutan lengkap genom bakterium Escherichia colli, sumbangan yang diterbitkan pada tahun 1997 dalam jurnal Sains , salah satu yang paling terkenal di dunia saintifik. Sehingga kini, projek pusat kumpulan itu adalah edisi buku elektronik fisiologi bakteria ini dan lain-lain.

Genomik adalah kajian ke atas keseluruhan sifat-sifat genom: struktur, interaksi dan fungsi komponennya. Genom adalah bahan genetik organisma, dan mengandungi semua maklumat yang diperlukan untuk penciptaan dan perkembangan makhluk itu dan pemindahan ciri-cirinya dari generasi ke generasi.

Pengetahuan yang diperoleh daripada sains genomik berkembang setiap hari. Hanya sekitar 500 artikel saintifik setiap tahun yang dihasilkan di sekitar Escherichia colli. "Ia adalah organisma yang paling terkenal di peringkat molekul. Daripada ia dilahirkan biologi molekul, "kata ahli sains universiti itu.

Kumpulan genomik komputasi mengkaji dan memelihara data yang ditangkap dalam kesusasteraan saintifik, yang kemudian akan ditafsirkan oleh penyelidik lain.

"Kami adalah kurator, kami membaca artikel dan mengekstrak bukti dan penemuan, mengarang semua maklumat itu dalam struktur pengiraan yang membolehkan kami mewakili sel-sel dan interaksi mereka", menyoroti Julio Collado.

Para saintis lain bertanggungjawab untuk memahami makna data ini dan membuat kesimpulan, seperti menjelaskan mengapa manusia dan lalat sangat berbeza jika gen tersebut bersamaan dengan 60%; atau mengapa beberapa ahli keluarga membina jenis kanser tertentu.

Menghadapi panorama ini, Collado Vides tertanya-tanya apa nasib bakteria Escherichia colli, sebagai subset pengetahuan biologi yang boleh menyumbang kepada genomik masa depan. "Kami tahu banyak tentang satu organisma tunggal bahawa cabaran adalah untuk mengintegrasikan semua pengetahuan yang dihasilkan para saintis untuk mewakili kerumitan biologi."

Dengan infrastruktur peringkat pertama Kumpulan Komputasi Genomik, ahli-ahlinya membangunkan kaedah meramalkan rangkaian pengawalseliaan, faktor transkripsi dan persatuan fungsian antara gen.

Sains menyumbang untuk meningkatkan kualiti kehidupan kita, menyertai Agenda Sains dan Inovasi Rakyat Citizen, satu konsultasi nasional di mana anda boleh memilih cabaran yang anda anggap perlu menghadapi sains dan teknologi untuk mencapai kualiti hidup yang lebih baik pada tahun 2030 Anda boleh mengundi cabaran yang paling penting bagi anda: www.agendaciudadana.mx

Ikuti kami di @GetQoralHealth, GetQoralHealth di Facebook dan YouTube